26 сентября 2016 года было проведено всенародное голосование (референдум) с целью внесения изменений в Конституцию Азербайджанской Республики. После официального объявления Референдума – 27 июля решением Центральной Избирательной Комиссии был утвержден Календарный План и все предусмотренные проекты и мероприятия были осуществлены в соответствии с ним. Граждане, имеющие намерение создать инициативную группу по референдуму, после объявления всенародного голосования в предусмотренных в законодательстве сроках и порядке, проведя свои собрания с участием инициаторов, обратились в ЦИК с уведомлением о создании инициативной группы. В целом, о своем намерении присоединиться к референдуму объявили 5 инициативных групп («Йени Азербайджан», «Гражданское общество», «Муниципалитет», «Республика» и «Республиканская Альтернатива»), всем группам были розданы подписные листы с целью сбора подписей для регистрации. Инициативная группа «Республиканская Альтернатива» не вернула в Комиссию ни один документ, требуемый для регистрации, включая подписные листы. Регистрация инициативной группы «Республика» была не возможна, в силу того, что группа не смогла предоставить действительные подписи в необходимом количестве.
В итоге три инициативные группы («Йени Азербайджан», «Гражданское общество», «Муниципалитет») пройдя регистрацию в ЦИК, получили право на участие в процессе референдума. После завершения стадии регистрации началась стадия предреферендумной агитации. Было выделено 256 (128 – открытых, 128 – закрытых) мест, охватывающих территории всех избирательных округов, и позволяющих в свободной форме встретиться с избирателями, а также являющихся бесплатными для всех сторон, вне зависимости от политической и иной принадлежности, на территории каждого избирательного участка размещены многочисленные крупные агитационные стенды для размещения печатных материалов. Начиная с 8 августа началась печать бюллетеней для голосования, в предусмотренных в законодательстве сроке и порядке были своевременно распечатаны всего 5280924 бюллетеня для голосования и предоставлены сначала окружным, а затем участковым избирательным комиссиям.
Для обеспечения прав голосования граждан Азербайджана, проживающих за пределами Азербайджанской Республики, в соответствии с требованиями Избирательного Кодекса в связи с всенародным голосованием (референдум) было в целом создано 38 избирательных участков в расположенных за рубежом дипломатических представительствах и консульских учреждениях. Как и иные избирательные участки, расположенные на территории страны, эти участки также были оснащены необходимыми документами для референдума и иным оборудованием благодаря деловому сотрудничеству ЦИК с Министерством Иностранных Дел и приведены в полную готовность ко дню голосования.
Со дня объявления всенародного голосования и до полного завершения процессов на горячую линию за номером 115 и электронные горячие линии, действуюшие в связи с избирательными вопросами, включая списки избирателей, всего поступило 551 обращение, на все обращения была оказана оперативная реакция ЦИК, приняты необходимые меры. Поступившие обращения были в основном о проверке данных в списках избирателей, внесении изменений в случаях необходимости, правовых вопросах и др. С целью наблюдения референдума всего был зарегистрирован 53531 местный наблюдатель.
Из 1097 местных наблюдателей, прошедших регистрацию в ЦИК с намерением вести наблюдение на территории всей республики 784 человек присоединились к референдуму от неправительственных организаций, 111 человек по инициативе агитационных групп по референдуму, 200 человек – по своей инициативе, 2 человека получив специальное разрешение, приобрели право на участие на заседаниях ЦИК. Другая группа местных наблюдателей была аккредитована соответствующими ОИК для ведения наблюдения внутри определенного избирательного округа. Число наблюдателей этой категории было 52434, из них 2695 человек присоединились к процессу наблюдения референдума по инициативе политических партий, 1046 человек - НПО, 14718 человек - агитационных групп по референдуму, 33975 человек – по своей собственной инициативе. К процессу наблюдения также присоединились 18 межднародных организаций и 117 международных наблюдателей из 33 стран. Как местные, так и международные наблюдатели были обеспечены соответствующими дощечками. Наряду с действующими на территории страны СМИ, без какой бы то ни было регистрации, к наблюдению также присоединились 16 представителей международных СМИ, они сыграли важную роль в информировании мировой общественности в связи с референдумом.
В соответствии с требованием Избирательного Кодекса, Лига Защиты Трудовых Прав Граждан (совместно с организацией «AJF&Associates İnc.» (США)), Центр Независимого Консультирования и Помощи Гражданскому Обществу (совместно с французским Институтом Социологических Исследований «Opinion Way»), Центр Независимых Исследований «ELS» и Мониторинговый Центр «Rəy» с целью проведения exit-poll обратились в ЦИК, все обращения были обсуждены членами Комиссии и встречены с одобрением, указанные организации были зарегистрированы.
Практика использования веб-камер, применяемых в истории выборов Азербайджана, начиная с 2008 года и позволяющих вживую наблюдать процесс голосования посредством интернета, была продолжена и на референдуме. Наряду со всеми иными средствами для обеспечения прозрачности на всеобщем голосовании, были установлены веб-камеры на 1000 избирательных участках, охватывающих географию всей страны (примерно на 20% участков, на которых проводится референдум), за исключением аккупированных территорий.
В день проведения референдума посредством веб-камер было осуществлено более 115000 просмотров из разных стран и мест мира. В день голосования – 26 сентября в 8:00 голосование началось по всей стране и избиратели, придя на избирательные участки, в свободной форме выразили свою волю. 11 октября 2016 года на заседании Центральной Избирательной Комиссии был подведен итог всенародному голосованию, составлен протокол ЦИК об общих итогах голосования, члены Комиссии подписав утвердили его.